Thông tư 91/2026/TT-BTC hướng dẫn Luật Quản lý thuế về hóa đơn, chứng từ điện tử chi tiết như thế nào?

Ngày 30/6/2026, Bộ Tài chính đã chính thức ban hành thông tư 91/2026/TT-BTC hướng dẫn chi tiết về hóa đơn điện tử (HĐĐT) và chứng từ điện tử.

Qua bài viết này, Nền tảng Kế toán dịch vụ MISA ASP sẽ tổng hợp toàn văn những điểm trọng yếu nhất mà kế toán dịch vụ cần nắm vững để áp dụng ngay từ hôm nay.

1. Tổng quan nội dung Thông tư 91/2026/TT-BTC

Thông tư 91/2026/TT-BTC quy định chi tiết một số điều của Luật Quản lý thuế 2025 và Nghị định 254/2026/NĐ-CP nhằm hướng dẫn thi hành các nội dung liên quan đến hóa đơn, chứng từ điện tử.

Các nhóm nội dung lớn bao gồm:

• Về hóa đơn điện tử: Quy định chi tiết về đăng ký sử dụng; định dạng dữ liệu; ủy nhiệm lập hóa đơn; xử lý sai sót; các tiêu chí xác định người nộp thuế có rủi ro cao và các trường hợp ngừng/tạm ngừng sử dụng HĐĐT.

• Về chứng từ điện tử: Quy định định dạng, xử lý chứng từ điện tử đã lập, ký hiệu mẫu và chứng từ tham khảo.

• Quy trình thủ tục hành chính: Trình tự cấp HĐĐT theo từng lần phát sinh; nội dung HĐGTGT kiêm tờ khai hoàn thuế; trình tự tiêu hủy hóa đơn giấy, biên lai giấy cũ…

• Cơ chế khuyến khích: Biện pháp thúc đẩy người mua lấy hóa đơn và quy trình khen thưởng cho người tiêu dùng tố giác các cơ sở kinh doanh không lập hóa đơn.

2. 13 trường hợp HĐĐT không nhất thiết phải có đầy đủ nội dung từ 1/7/2026

Đây là phần thông tin cực kỳ quan trọng đối với kế toán dịch vụ khi kiểm tra tính hợp lệ của hóa đơn đầu vào – đầu ra cho khách hàng. Căn cứ theo Mục 9 Phụ lục kèm theo Nghị định 254/2026/NĐ-CP, các trường hợp đặc biệt bao gồm:

• Chữ ký số của người mua: Không nhất thiết phải có (kể cả xuất khẩu). Trừ trường hợp hai bên có thỏa thuận kỹ thuật riêng.

• Hóa đơn do Cơ quan thuế cấp theo từng lần phát sinh: Không nhất thiết có chữ ký số của cả người bán và người mua.

• Hóa đơn siêu thị, trung tâm thương mại, rạp chiếu phim (khách lẻ): Không nhất thiết có tên, địa chỉ, số định danh và chữ ký số người mua.

• Hóa đơn bán xăng dầu cho cá nhân: Không nhất thiết có tên, địa chỉ, số định danh và chữ ký số người mua.

• Hóa đơn dạng Tem, vé, thẻ: Không nhất thiết có chữ ký số người bán (trừ vé do CQT cấp mã), thông tin người mua, tiền thuế, thuế suất. Nếu có sẵn mệnh giá thì miễn cả đơn vị tính, số lượng, đơn giá.

• Chứng từ vận tải hàng không quốc tế (xuất qua website/e-commerce cho cá nhân): Không nhất thiết có ký hiệu, số thứ tự hóa đơn, thuế suất, MST, địa chỉ người mua, chữ ký số người bán.

• Hóa đơn xây dựng, lắp đặt, bán nhà theo tiến độ: Không nhất thiết phải có đơn vị tính, số lượng, đơn giá.

• Phiếu xuất kho kiêm vận chuyển nội bộ: Không thể hiện tiền thuế, thuế suất, tổng tiền thanh toán. Tên/địa chỉ người mua/bán được thay bằng thông tin kho xuất/nhận và người vận chuyển.

• Phiếu xuất kho hàng gửi bán đại lý: Thể hiện thông tin hợp đồng kinh tế, người/phương tiện vận chuyển, kho xuất/nhận, không yêu cầu sắc thuế như hóa đơn thương mại thông tin thông thường.

• Hóa đơn thanh toán Interline giữa các hãng hàng không (theo IATA): Không nhất thiết có ký hiệu, tên/địa chỉ/MST/chữ ký số người mua, đơn vị tính, số lượng, đơn giá.

• Hóa đơn hàng không xuất cho đại lý (theo bảng kê đối chiếu): Không nhất thiết phải có đơn giá.

• Hóa đơn của DN quốc phòng an ninh: Không nhất thiết có đơn vị tính, số lượng, đơn giá.

• Hóa đơn kinh doanh casino, trò chơi có thưởng, hóa đơn TMĐT, hóa đơn ủy nhiệm: Được miễn giảm một số tiêu thức như thông tin định danh/chữ ký số của người mua hoặc người bán tùy trường hợp cụ thể.

3. Hiệu lực thi hành và quy định chuyển tiếp

Kế toán dịch vụ cần lưu ý mốc thời gian và các văn bản bị thay thế để tránh áp dụng sai văn bản pháp luật:

• Ngày có hiệu lực: Thông tư 91/2026/TT-BTC chính thức có hiệu lực từ ngày 01/07/2026.
• Các văn bản hết hiệu lực: Thông tư 32/2025/TT-BTC, các quy định về hóa đơn chứng từ tại Nghị định 123/2020/NĐ-CP và Nghị định 70/2025/NĐ-CP chính thức bãi bỏ từ ngày 01/07/2026.

• Tính pháp lý của phụ lục: Thông tư gồm 05 Phụ lục; trong đó Phụ lục I đến IV là bắt buộc áp dụng, Phụ lục V dùng để tham khảo.

MISA ASP – Trợ lý đắc lực giúp Kế toán dịch vụ làm chủ chính sách mới

Việc áp dụng thông tư 91/2026/TT-BTC đòi hỏi quy trình kiểm soát hóa đơn của các đơn vị làm dịch vụ kế toán phải chuẩn xác và cập nhật hơn bao giờ hết.

Sử dụng nền tảng MISA ASP, các kế toán dịch vụ sẽ được cấu hình tự động các biểu mẫu hóa đơn, chứng từ điện tử mới nhất, tích hợp AI kiểm tra tính hợp lệ của hóa đơn đầu vào, giúp giảm thiểu tối đa sai sót và tiết kiệm đến 80% thời gian nhập liệu cho hàng loạt khách hàng cùng lúc. 

ĐĂNG KÝ TRẢI NGHIỆM MIỄN PHÍ MISA ASP NGAY TẠI ĐÂY!